Kirk
y su tripulación regresan a casa, sin su oficial científico
Spock, muerto en la última batalla. Allí, un extraño
comportamiento de Bones y la petición de Sarek les induce a tomar
la Enterprise, en contra de las órdenes de la Flota Estelar, para
volver al planeta Génesis. Mientras tanto, David Marcus y la teniente
Saavik bajan al planeta a investigar unas formas de vida animal que ha detectado
su nave, la cual sufre el ataque inesperado de un crucero de guerra klingon,
comandado por el comandante Kruge, que también desea conocer los
secretos del génesis y utilizarlo como poderosa arma destructiva.