La
nave Reliant topa accidentalmente con una colonia en Ceti Alpha V . Sus
habitantes, liderados por Khan (Ricardo Montalbán), super hombres
alterados genéticamente, toman el control de la nave de la flota
con el objetivo de vengarse de Kirk, el cual los abandonó en el pasado
en ese planeta. El almirante Kirk, abordo de la nave Enterprise en una misión
de adiestramiento de cadetes de la flota estelar, retoma el mando de la
nave debido a una llamada de emergencia de una estación científica
comandada por la doctora Marcus, autora del proyecto Génesis, (creador
de vida). Spock
muere intentando salvar al Enterprise y su tripulación.