ประเด็นแรกต้องพิจารณาก่อนว่าจะแบ่งพาร์ติชั่นเพื่อใช้กับ OS ตัวไหน DOS 6.22 , Windows 3.11 , Windows 95 OS/2 หรือ Windows NT เพราะทั้งหมดนั้นใช้วิธีการจัดการกับฮาร์ดดิสก์แตกต่างกัน สำหรับOS ที่ผมจะใช้งานนั้นคือ Windows 95 OSR1 ซึ่งระบบ FAT เป็น 16 บิต และขนาดต่อพาร์ติชั่นสูงสุดคือ 2 GB พร้อมทั้งมีข้อจำกัดคือขนาดของ Allocation Unit จะเปลี่ยนไปเมื่อขนาดของพาร์ติชั่นเปลี่ยนตามตารางต่อไปนี้
อีกส่วนหนึ่งที่ควรพิจารณาก็คือ Temp File ซึ่งเกิดจากการเรียกใช้โปรแกรมต่างๆ Windows 3.11 , Windows 95 , Windows NT ต่างก็บังคับว่าต้องมี การย้าย Temp มาไว้ในพาร์ติชั่นที่สร้างขึ้นเฉพาะช่วยแก้ปัญหาได้