No alto das grutas e afloramentos calcários, desenvolvem-se espécies de plantas próprias de tal habitat, com a presença de espécies que têm adaptações próprias do ambiente seco. Sob o aspecto ecológico, a superfície das rochas calcárias tem um ecossistema bastante diverso daqueles que o circundam de perto.
No interior das grutas, no ambiente onde é constante a escuridão, uma temperatura sem variações e alto grau higrométrico, desenvolve-se uma fauna e flora cavernícola com matizes "sui-generis". O estudo dos seres vivos habitantes das grutas é a base de toda a Bioespeleologia. Existem espécies de aves que reproduzem no interior das grutas, principalmente aves migratórias.
O conhecimento do ciclo vital dos morcegos - que podem ser vetores do vírus da raiva - de grande importância para a pecuária, depende do studo ecológico das formações espeleológicas.
Próximo as grutas e em seus afloramentos calcários, prolifera geralmente exuberante mata. Infelizmente, os "civilizados" de hoje encarregam-se de destruir aquela vegetação abundante, impunes pela lei dos homens, mas já pagando um preço bastante alto, cobrado pela natureza à sua atividade irresponsável, ciminosa e suicida.