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Shinji Ikari... El es uno de los protagonistas de esta serial. Conocido tambien como el "third children", fue el tercer niño elegido para pilotear a las maquinas Eva, y su maquina es el EVA-01.  Shinji tiene una historia bastante triste. Hijo de Gendou Ikari y Yui, fue abandonado por su padre cuando era pequeño y también quedó huérfano ya que su madre murió en un accidente de prueba del EVA-01. Shinji tiene una personalidad un tanto débil la cual lo lleva a dudar de su existencia en la tierra y de la confianza en la gente.  Es un niño muy reprimido, bastante a la defensiva, ya que constantemente vive con el temor de que  lo hieran mas. Es un chico muy tímido tambien.  Shinji tiene 14 años.

 
  

Asuka Langley... Ella es conocida como el "second children" y pilotea el EVA-02. Ella tiene 14 años también y es una niña genio ya que antes de llegar a Japón vivía en Alemania, y a su temprana edad había egresado ya de la universidad. Asuka es parte japonesa y parte alemana. Sus padres estan separados. Ella también tuvo una infancia muy triste ya que su madre estaba con una depresión y mas encima se había vuelto loca, y cuando a Asuka le anunciaron que habia sido escogida por la NERV para pilotear los evas (a los 8 años) encontró a su mama colgada de el techo ahorcada. Su madre se había suicidado. Su unica ambicion en la vida es hacerse notar a la gente ya que tuvo ausencia de ello con su madre. Asuka tiene una personalidad increiblemente fuerte.

 
  

Rei Ayamani... Ella es conocida como el "first children" y fue la primera elegida para pilotear un Eva. Ella tiene el EVA-00. Rei es una chica muy reprimida, que apenas dice algunas palabras. Nadie realmente la comprende, y generalmente creen que ella no tiene sentimientos, pero en el fondo es muy especial. También tiene 14 años.

 
  

Misato Katsuragi... Ella es parte de la NERV y también la encargada de cuidar a los niños (Shinji, Asuka y Rei). Ella tiene un pasado bastante triste ya que su padre murió cuando ocurrió el Segundo Impacto. Ella es una mujer de unos 28-29 años bastante vividora y con una personalidad fuerte pero simpática. Ella es la dueña de Pen-pen el simpático pinguino.

 
 
 

Gendo Ikari... Gendo es el padre de Shinji y es el primer comandante de la NERV. Estuvo casa con Yui, pero luego de la tragica muerte de esta, el se encerro en sus sentimientos de depresion y se transformo en una persona fria y calculadora. El nunca crio a Shinji, es mas, lo dejo a cargo de un amigo de el para que lo cuidara. En el momento en que Shinji llego a la NERV, Gendo se dio cuenta que habia perdido mucho de su vida y de la vida de su hijo en su obsesion por encontrar un modo de volver a reunirse con su querida Yui. Gendo sabe todos los planes de SEELE, y es el principal comunicador entre la NERV y SEELE.

 
 
 

Ritsuko Akagi... Ritsuko es la operadora y creadora de MAGI, la computadora central de NERV. Tiene un gran sentimiento de odio hacia su madre, y siempre le habla a la computadora Capser, como si fuera su madre q estuviera ahi. Ritsuko tuvo un romance con Gendo, el mismo hombre que una vez enamoro a su madre. La muerte de Ritsuko es bien tragica (a mi me dio mucha pena), porque su intento de suicidio no funciona y finalmente es asesinada por....

 
 
 

Kaji Ryouji... Llego desde la rama de NERV en Alemania, trayendose consigo a la second child Asuka. Trabajaba para la NERV en Alemania, pero se cree que se infiltro en los cuarteles de Alemania para averiguar todos los secretos de la institucion. Renuncio y se fue a la rama de Japon a seguir con sus investigaciones. Debido a su curiosidad fue asesinado, dejandole la informacion de su investigacion para que la continuara Misato. El y Misato fueron novios durante los años de estudiantes pero se separaron. Cuando el volvio a Japon continuaron su relacion.

 
 
 

Maya Ibuki... Maya trabaja en la NERV, y tiene una relacion muy especial con Ritsuko, como que fuera una relacion madre-hija. Ella es la encargada de de monitorear el estado de los evas y de entregarles informacion necesaria.

 
 
 

Tohji... Tohji era el piloto del EVA-04. Fue compañero de Shinji, Asuka y Rei. En un principio le pegaba a Shinji porque le daba mucha rabia que Shinji fuera tan pacifico y reservado como era, pero despues se convierte en un amigo. A Tohji lo contratan como piloto de la NERV para que trate un nuevo EVA que esta en periodo de experimentacion pero su EVA al final resulta ser un angel. Shinji es ordenado matarlo y lo deja muy herido. Se dice que perdio un brazo y movilidad en las piernas.