Las rocas que constituyen la península de Yucatán son sedimentarias del tipo caliza. La acción del agua sobre este tipo de roca origina un relieve de tipo kárstico. El agua se infiltra y escurre a través de las fisuras del terreno, moldeando la capa caliza y dando lugar a los cenotes, cavernas y otras formaciones típicas.
Los cenotes, son profundos pozos naturales. Constituyen quizá, el fenómeno natural más interesante de Yucatán. Sin ellos el antiguo pueblo maya hubiera carecido de agua suficiente, pues no hay ríos ni lagos de importancia en Yucatán. Estos pozos fueron llamados ts'onot por los Mayas, y de este bocablo derivaron los españoles los de cenote o senote.
Otras fuentes de agua existen en Yucatán, a saber: las saternejas, que son agujeros naturales de las rocas que en la época de lluvias se llenan de agua, permaneciendo así durante algín tiempo. También hay aguadas naturales y artificiales; algunas son quizá, antiguos cenotes; otras fueron cavadas por los viejos mayas para servir de despositos durante la estación seca.
Cerca del mar existen ciénegas, estuarios salados y lagunas; dentro del mar y a lo largo de la costa se hallan, finalmente, las llamadas pozas, a las que algunos consideran como desembocaduras de ríos subterráneos que comunican los cenotes entre sí.

Tipos de cenotes
Los cenotes pueden ser divididos en cuatro tipos:
A) Los en forma de cántaro, con una pequeña abertura superior y diámetro creciente hacia la superficie del agua y aún más abajo.
B) Los abiertos, con paredes sensiblemente verticales.
C) Los llamados "Antiguos cenotes", cuyas paredes se separan por encima del agua; muchos de este tipo están secos o conservan un poco de líquido en la estación pluviosa.
D) Los de caverna con entrada por un lado.

El relieve kástico puede ser superficial y subterráneo. Cuando se presenta superficialmente, hay depresiones, lagos, lagunas y aguadas; mientras si es subterráneo, hay sumideros, cenotes, cavernas y grutas.
Las depresiones se forman por hundimientos locales que en ocasiones tienen hasta 300m de diámetro; sus lados son muy inclinados y se localizan en el extremo noreste del estado de Yucatán.
Los lagos y lagunas se deben a hundimientos del terreno; aunque abundan en Campeche y Quintana Roo, éstos no se encuentran en el estado de Yucatán.