3X01	The Blessing Way	Le chemin de la bénédiction	22-09-95
3X02	Paper Clip	Opération presse-papier	29-09-95
3X03	D.P.O.	Coup de foudre	06-10-95
3X04	Clyde Bruckman's Final Repose	Voyances par procuration	13-10-95
3X05	The List	La liste	20-10-95
3X06	2Shy	Meurtres sur Internet	03-11-95
3X07	The Walk	Corps astral	10-11-95
3X08	Oubliette	Souvenir d'oubliette	17-11-95
3X09	Nisei	Monstres d'utilité publique (1/2)	24-11-95
3X10	731	Monstres d'utilité publique (2/2)	01-12-95
3X11	Revelations	Révélations	15-12-95
3X12	War of the Coprophages	La guerre des coprophages	05-01-96
3X13	Syzygy	Âmes damnées	26-01-96
3X14	Grotesque	Le visage de l'horreur	02-02-96
3X15	Piper Maru	L'épave (1/2)	09-02-96
3X16	Apocrypha	L'épave (2/2)	16-02-96
3X17	Pusher	Autosuggestion	23-02-96
3X18	Teso dos bichos	Malédiction	08-03-96
3X19	Hell Money	La règle du jeu	29-03-96
3X20	Jose Chung's From Outer Space	Le seigneur du magma	12-04-96
3X21	Avatar	La visite	26-04-96
3X22	Quagmire	Les dents du lac	03-05-96
3X23	Wetwired	Hallucinations	10-05-96
3X24	Talitha Cumi	Anagramme	17-05-96

The Blessing Way

Réalisateur : R. W. Goodwin       Auteur : Chris Carter

Scully se voit imposer un congé forcé pour son insubordination tandis que Mulder oscille entre la vie et la mort.

Paper Clip

Réalisateur : Rob Bowman       Auteur : Chris Carter

La recherche de Mulder afin de trouver des renseignements concernant l'implication de son père dans le projet secret l'amène dans une mine abandonnée.

D.P.O.

Réalisateur : Kim Manners       Auteur : Howard Gordon

Lorsque plusieurs adolescents meurent frappés par la foudre, Mulder et Scully enquête sur un adolescent semblant contrôler les éclairs.

Clyde Bruckman's Final Repose

Réalisateur : Rob Bowman       Auteur : Darin Morgan

Mulder et Scully demande l'aide d'un homme pouvant prédire la mort des gens pour attraper un tueur de diseurs de bonne aventure.

The List

Réalisateur : Chris Carter       Auteur : Chris Carter

Un prisonnier exécuté semble revenir de la mort pour accomplir sa vengeance.

2Shy

Réalisateur : David Nutter       Auteur : Jeff Vlaming

Mulder et Scully traquent un homme qui déniche ses victimes sur Internet.

The Walk

Réalisateur : Rob Bowman       Auteur : John Shiban

Un blessé de guerre amputé de ses quatre membres semble est le responsable de l'exécution des proches de certains vétérans.

Oubliette

Réalisateur : Kim Manners       Auteur : Charles Grant Craig

Mulder protège une femme soupçonnée d'être au courant de l'enlèvement d'une jeune fille.

Nisei

Réalisateur : David Nutter       Auteurs : Chris Carter, Howard Gordon, Frank Spotnitz

Mulder tente de retrouver une étrange créature après avoir visionné le vidéo d'une autopsie d'un prétendu extraterrestre.

731

Réalisateur : Rob Bowman       Auteur : Frank Spotnitz

Mulder embarque sur le train contenant une des mystérieuses créatures tandis que Scully en apprend plus sur son propre enlèvement.

Revelations

Réalisateur : David Nutter       Auteur : Kim Newton

Lorsque onze faux prophètes sont tués, Scully tente de protéger un jeune garçon qui pourrait bien être la prochaine victime.

War of the Coprophages

Réalisateur : Kim Manners       Auteur : Darin Morgan

Les habitants d'une petite ville paniquent lorsque plusieurs personnes semblent être tuées par des coquerelles.

Syzygy

Réalisateur : Rob Bowman       Auteur : Chris Carter

Mulder et Scully ne s'entendent pas du tout lorsqu'ils enquêtent une série de morts attribuées par la police locale à un culte à Satan.

Grotesque

Réalisateur : Kim Manners       Auteur : Howard Gordon

Scully soupçonne Mulder d'avoir perdu la raison lorsqu'ils enquêtent sur une série de meurtres qui continue après l'arrêt du responsable.

Piper Maru

Réalisateur : Rob Bowman       Auteurs : Frank Spotnitz et Chris Carter

L'équipage d'un bateau français est exposé à des niveaux élevés de radiation après avoir retrouvé un être vivant dans une épave datant de la Deuxième Guerre mondiale.

Apocrypha

Réalisateur : Kim Manners       Auteurs : Frank Spotnitz et Chris Carter

Mulder tente de retrouver l'extraterrestre tandis que Scully enquête sur l'homme ayant tiré sur Skinner.

Pusher

Réalisateur : Rob Bowman       Auteur : Vince Gilligan

Un homme qui contrôle l'esprit des gens découvre en Mulder un adversaire à sa taille.

Teso Dos Bichos

Réalisateur : Kim Manners       Auteur : John Shiban

Un artefact ramené d'Amérique du Sud semble responsable de la mort de ceux qui l'ont amené aux États-Unis.

Hell Money

Réalisateur : Tucker Gates       Auteur : Jeff Vlaming

Mulder et Scully découvrent, dans le quartier chinois, une loterie dont les heureux gagnants payent de leur vie.

Jose Chung's From Outer Space

Réalisateur : Rob Bowman       Auteur : Darin Morgan

Un auteur tente de découvrir ce qui s'est réellement passé lorsque deux adolescents prétendent avoir été enlevés par des extraterrestres.

Avatar

Réalisateur : James Charleston       Auteur : Howard Gordon (Histoire de David Duchovny et Howard Gordon)

Mulder et Scully tente d'innocenter Skinner lorsque celui-ci est accusé du meurtre d'une prostituée.

Quagmire

Réalisateur : Kim Manners       Auteur : Kim Newton

Mulder se porte volontaire pour enquêter sur la disparition d'un homme lorsqu'il apprend que cette disparition a eu lieu aux abords d'un lac où vit un monstre marin.

Wetwired

Réalisateur : Rob Bowman       Auteur : Mat Beck

Scully soupçonne Mulder d'avoir changé de camp lorsqu'elle et Mulder enquêtent sur une série de meurtres provoqués par la télévision.

Talitha Cumi

Réalisateur : R. W. Goodwin       Auteur : Chris Carter (Histoire de David Duchovny et Chris Carter)

Mulder et Scully tentent de retrouver un homme qui guérit les blessures par un simple toucher.